Është mirë të lani penisin çdo ditë.
Në rast se nuk jeni bërë synet, pastroni gjatë kësaj kokën e penisit nën lafshë. Për këtë, tërhiqni lafshën prapa dhe lani kokën e penisit me ujë të ngrohtë dhe pak sapun. Tek disa djem dhe meshkuj, koka e penisit është e ndjeshme ndaj sapunit. Prandaj më mirë përdorni sapun pa erë ose mos përdorni fare sapun.
Nën lafshë mund të krijohet një shtresë e bardhë. Kjo shtresë quhet smegma. Ajo mban erë dhe përmban baktere, qeliza të lëkurës dhe mbetje të urinës. Prej kësaj, koka e penisit mund të infektohet (balanitis). Gjatë marrëdhënieve seksuale të pambrojtura ose seksit oral, këto baktere mund t´i transmetohen partneres ose partnerit.
Disa meshkuj i rruajnë qimet pubike. Kjo nuk është e nevojshme për një higjenë të mirë.
بهتر است که هر روز آلت جنسی خود را بشوئید.
اگر ختنه نشده اید، کلاهک زیر پوست ختنه گاه (پیش پوست) را هم بشوئید. برای این کار پوست ختنه گاه را به عقب بکشید و کلاهک را با آب گرم و کمی صابون بشوئید. کلاهک آلت جنسیِ بعضی از پسران و مردان، نسبت به صابون حساسیت نشان میدهد. در این صورت بهتر است از صابون بدون عطر استفاده کنید و یا اصلاً از صابون استفاده نکنید.
ممکن زیر پوست ختنه گاه، لایه سفیدی تشکیل شود که نام آن اسمگما یا پنیرک است که بو میدهد و حاوی میکرب، سلولهای پوست و بقایای ادرار است. این امر ممکن است باعث التهاب کلاهک آلت جنسی (بالانیت) شود. میکربها ممکن است در هنگام آمیزش جنسی بدون محافظت یا سکس دهانی به پارتنرتان منتقل شود.
بعضی مردها موهای اندامهای جنسی خارجی (زهار) خود را میتراشند. این کار برای بهداشت خوب ضروری نیست.