Най-добре е да миете пениса си всеки ден.
Ако не сте обрязани, измивайте и главичката под препуциума. Изтеглете препуциума и измийте главичката с топла вода и малко сапун. При някои момчета и мъже главичката е чувствителна към сапуна. В този случай е най-добре да използвате сапун без парфюм или изобщо да не го използвате.
Под препуциума може да се появи бял секрет. Той се нарича смегма. Тя мирише и съдържа бактерии, кожни клетки и остатъци от урина. Това може да доведе до възпаление на главичката (баланит). Бактериите могат да се предадат на партньорката или партньора по време на незащитен полов акт или орален секс.
Някои мъже бръснат окосмяването си. Това не е необходимо за добрата хигиена.
بهتر است که هر روز آلت جنسی خود را بشوئید.
اگر ختنه نشده اید، کلاهک زیر پوست ختنه گاه (پیش پوست) را هم بشوئید. برای این کار پوست ختنه گاه را به عقب بکشید و کلاهک را با آب گرم و کمی صابون بشوئید. کلاهک آلت جنسیِ بعضی از پسران و مردان، نسبت به صابون حساسیت نشان میدهد. در این صورت بهتر است از صابون بدون عطر استفاده کنید و یا اصلاً از صابون استفاده نکنید.
ممکن زیر پوست ختنه گاه، لایه سفیدی تشکیل شود که نام آن اسمگما یا پنیرک است که بو میدهد و حاوی میکرب، سلولهای پوست و بقایای ادرار است. این امر ممکن است باعث التهاب کلاهک آلت جنسی (بالانیت) شود. میکربها ممکن است در هنگام آمیزش جنسی بدون محافظت یا سکس دهانی به پارتنرتان منتقل شود.
بعضی مردها موهای اندامهای جنسی خارجی (زهار) خود را میتراشند. این کار برای بهداشت خوب ضروری نیست.